Mi trovo ad avere a che fare con un programma di gestione di casa domotica
scritto in Java ora devo modificare alcune funzionalità ricompilarlo ed eseguirlo 

i problemi sono:

1) Come compilare  l'intero programma e renderlo funzionante visto che è
costituito da classi suddivise.

2) oltre i sorgenti ho alcuni file con estensione punto JAR ma che eseguendoali
non succede nulla. "Può essere perchè il SO su cui gira il programma originario
e Linux"?

Attendo risposte 

    Ciao,
allora dal titolo suppongo che questo progetto lo dovresti importare in 
Netbeans giusto?
Netbeans ti permette di creare un progetto da codice già esistente, cerca 
nel menu File-> nuovo e vedi.
Importato il progetto dovresti fare degli "aggiustamenti": 
1) CREARE UNO O  + PACKAGE all'interno dei quali inserre i file.java
 in questo modo avrai un insieme di  gruppi-package (generalmente in 
un package ci stanno diversi file.java che fanno più o meno parte dello 
stesso modulo, logica del programma).
VEDRAI UNA STRUTTURA DEL GENERE: (a sinistra di default)

-<packageDisney>
      -<Pippo.java>
      -<Pluto.java>
     -<Topolino.java>
-<packagePixar>
     -<xman.java>
    -<superman.java>

2)IMPORTARE LE LIBRERIE CHE SERVONO AL PROGETTO PER 
POTERLO COMPILARE E/O ESEGUIRE.
Questo lo puoi fare sempre scorrendo la struttura verso il basso, fai 
destra-click su ImportLibrary e scegli il percorso dei tuoi file JAR (QUELLI 
CHE NON SI AVVIANO  QUANDO CI CLICCHI)
A questo punto dovresti avere l'ambiente completo, ciò non significa che 
compili e funzioni, sopratutto se il codice è stato scritto con l'JDK per 
windows  e adesso ti trovi su Linux, in realtà la compatibilità TOTALE non 
esiste dipende da come hai scritto il codice.
Ciao e rispondimi.